Cellules souches embryonnaire :

Elles sont isolées à partir de l'embryon âgé de quelque jours. Elles sont pluripotentes c'est-à-dire mises dans des conditions adaptées,elles peuvent donner naissance à tous les tissus d'un organisme et non plus à un embryon complet.

Cellules souches adultes :

Elles résident dans les microenvironnements dites niches. leurs rôle est de maintenir l'homéostasie de certains oragnes en renouvelant des cellules de manière continue tout au long de la vie ( cellules du sang,...) mais aussi de manière plus soutenue lors d'une lésion (régénération du muscle).